Святой Иоанн Манглийский родился в 1668 Давид-Гареджи. Мальчик получил хорошее и духовное воспитание от своих родителей. Благодаря хорошим делам и добродетельности Иоанн быстро получил чин иеромонаха, а спустя несколько лет стал епископом Манглиси.
В 1724 году Святой Иоанн переехал из Давид-Гареджи в городДербент (Дагестан), где построил деревянную церковь и начал там проповедовать христианство среди местных жителей. Ему помогали там 11 благочестивых верующих. Смиренная жизнь и чудеса сотверенные Св. Иоанном привлекали к нему внимание мусульман-дагестанцев, и даже правительство замечало его неутомимую проповедническцю деятельность.
В это время грузинский царь Вахтанг VI (1703-1724) и Петра I (Россия) пропогандировали православную веру на берегах Каспийского моря. Оба короля признали важность Святого Иоанна в популяризации христианства, и щедро помогали святому. С их помощью Святой Иоанн построил одну церковь в честь Рождества Пресвятой Богородицы, и другую в честь великомученицы Екатерины.
В 1737 Иоанн оставил своих учеников в Дагестане и отправился в Астрахань, туда, где Волга впадает в Каспийское море. Здесь он построил церковь в честь Иоанна Богослова, которая была преобразована в монастырь в 1746 году. Архимандрит Герман (один ученик Святого Иоанна) был возведен настоятелем этого монастыря.
В то время как Иоанн был в Астрахани он узнал, что многие этнические грузины из городов Кизляре в Осетии приезжали в Астрахань чтобы посетить храм, а все из-за того что в ихних городах не было церкви, в которой можно было бы совершать богослужения. Святой поехал в Кизлярск и с помощью жителей города построил церковь и открыл специальную подготовительную школу для проповедников.
28 марта 1751, святой Иоанн умер в городе Кизляре в возрасте восьмидесяти лет. Он был похоронен в церкви, которую он сам и построил.
Позже, по приказу царя Теймураза II (с 1744-1761) мироточивые мощи Святого Иоанна были перевезены в Тбилиси и похоронены в Сионском соборе, перед иконой Божией Матери.